酵母RNA的提取方法:浓盐法。酵母菌外层是厚达1.2µm的细胞壁,其化学成分是葡聚糖(30-40%)和甘露聚糖(30%),此外,脂类8.5-13.5%,蛋白质6-8%,还含有几丁质,酵母菌的葡聚糖,分子是为240000道尔顿,是一种分枝聚合物,葡聚糖与甘露糖之间由蛋白质维系起来。近10%的甘露聚糖的侧链通过磷酸二酯键与磷酸边接,所有这些连接方式都使得酵母提取物首要的也是关键的是如何破坏细胞壁。破壁方法有自溶破壁、酶法破壁等多种方法,而用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞的通透性,就可以使核酸从细胞内释放出来。由于RNA钠盐易溶于水,在含盐的菌体溶液中,RNA有较高的溶解度,这样,通过控制温度使蛋白质变性沉淀,苏州正规RNA提取试剂生产厂家,苏州正规RNA提取试剂生产厂家,通过离心将RNA及蛋白质和脱核酵母菌体分离,从而达到提取之目的。其中食盐起到自溶促进剂,以及防腐与脱臭的作用。在匀质化或溶解样品中,苏州正规RNA提取试剂生产厂家,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成分。苏州正规RNA提取试剂生产厂家
RNA提取试剂的选择:首先,要确定材料的可用性。尽管现有的RNA提取试剂都用压制RNase的成分,但提取的材料仍需谨慎处理。提取的材料的新鲜度是获取完整RNA的关键,但是由于种种原因无法立即从新鲜材料中提取RNA时,使用Takara公司的样品保护剂SampleProtectorforRNA/DNA可以免去使用液氮或超低温冰箱的不便,同时也可以有效解决组织、细胞样品的短时间保存及运输问题。此外,如果将不同时期收集的样品都预先存放于本试剂中,可以做到立即终止并固定RNA表达的时序变化,减少实验组间的误差苏州正规RNA提取试剂厂家供应目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。
常用总RNA提取试剂:异硫氰酸胍法和Trizol法是动物组织及动物细胞总RNA提取较常用的方法,异硫氰酸胍法操作简单快捷,适用于样本足够大的常规动物组织;Trizol法裂解能力较强,尤其适合小样本及特别难提取的组织,如兔子皮肤,动物结缔组织等总RNA的提取;另外Trizol作为一种通用型的裂解试剂,还可以用于植物组织、细菌、菌类等组织的提取。对于含多糖多酚的植物组织如油茶、茶叶、油菜等还可以使用CTAB法进行总RNA的提取。提取RNA时我们经常遇到的问题是:(1)RNA产量较低;(2)RNA有严重的盐类污染;(3)RNA有严重的有机溶剂污染;(4)样品降解等问题。
RNA是核糖核酸,DNA是脱氧核酸。区别:紫外吸收:核酸的λm=260nm,碱基展开程度越大,紫外吸收就越厉害。当A=1时,DNA:50ug/ml,RNA和单链DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280还可来表示核酸的纯度。沉降速度:对于拓扑异构体(核苷酸数目相同的核酸),其沉降速度从达到小依次为:RNA;超螺旋DNA>解链环状DNA;松弛环状DNA;线形DNA也就是在离心管中较上层是线形DNA,较下面是RNA。电泳:核苷酸、核酸均可以进行电泳,泳动速度主要由分子大小来决定,因此,电泳是测定核酸分子量的好方法。DNA分子量测定较直接的方法:用适当浓度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以将其他形式的DNA变成线形DNA,用电镜测出其长度,按B-DNA模型算出bp数,根据核苷酸的平均分子量就可计算出DNA的分子量。植物RNA提取试剂产品特点:无需氯化铯梯度离心,无需氯化锂或乙醇沉淀。
RNA提取醇沉淀不是越多就越好。有些实验方案会推荐,在异丙醇沉淀后,用乙醇沉淀两次。实际上,任何提取实验,都会在纯度和得率这一对矛盾中取舍。醇沉淀会将脂溶性杂质去掉,但部分非脂溶性的杂质依然会连同RNA一起被沉淀下来。因此,多整几次,并不会让RNA的纯度翻倍,反而还会有降低得率的风险。一般情况下,异丙醇和乙醇各沉淀一次即可。但是,倘若预计RNA浓度很低,那就只能放弃纯度,在低温沉淀数小时,以换来较高的得率。围绕DEPC的玄学。许多实验方案会推荐使用0.1%DEPC处理RNA相关用水,以灭活RNase。这一点是要肯定的。不过,在使用DEPC的过程中,又充斥着一些玄学。高压灭菌后的DEPC水,会有一股“香甜”的味道。许多人会以为那是残留的DEPC而不敢用。实际上,这只是DEPC分解成CO2和乙醇后,产生的一些挥发性酯类副产物。以及参与RNAi作用的miRNA与siRNA等,可调节基因表达。苏州正规RNA提取试剂生产厂家
植物RNA提取试剂:提取的总RNA纯度极高,没有蛋白和其他杂质的污染。苏州正规RNA提取试剂生产厂家
细胞RNA提取的方法:实验提取步骤:标准Trizol提取步骤为液氮研磨--加入Trizol裂解--加入氯仿抽提--离心--加入氯丙醇沉淀--离心--酒精洗涤--离心。将细胞培养皿置于冰上,加入Trizol裂解5-10分钟,用泵头轻轻吹打后吸取液体放入进口EP管中。加入1/5体积的氯仿,上下混匀液体,4度静置10-15分钟。(氯仿为有机溶剂,有效的使有机相和无机相迅速分离。有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相)。4度离心15分钟,一定注意选择低温离心。离心后分成三层,RNA在上清里,从离心机轻轻拿出EP管,以免管内物质震荡导致下层沉淀激起。吸取上清的时候一定要动作轻柔,切忌吸取太多,一般吸到400-500ul,避免吸到下层沉淀,将液体置于新的EP管中。加入等体积异丙醇,4度静置10min,然后12000rpm离心10min。苏州正规RNA提取试剂生产厂家
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